Nintendo ha confirmado la vuelta de Samus a Nintendo 3DS el próximo año 2016 con un título diferente. Es Metroid Prime: Federation Force donde podrán disfrutar hasta cuatro jugadores en línea o localmente para afrontar juntos misiones en esta aventura de ciencia ficción en primera persona ambientada en el universo de Metroid Prime. Trabajarán en equipo para despejar bases infestadas de enemigos y lograr los objetivos de las misiones. Cuando completen las misiones podrán competir en Metroid Prime: Blast Ball, un juego en el que se enfrentan seis jugadores en dos equipos de tres para lanzar una especie de balón hasta la portería del contrario.